モータ容量にもよりますが、インバータを使うと漏れ電流が出ます。
実際にインバータの中にサーマルと同じ機能が含まれています。
長距離電線を引いてあると、漏れ電流が多くなります。
多くなった漏れ電流に対し、元々の電流が小さな容量のモータでは過負荷で無いのにサーマルはトリップしてしまいます。
 
ですから、サーマルは使わないと言われたのではないでしょうか？
無理にサーマルを使ってもかまわないとは思いますが、過負荷ではないのにトリップしますよ。